Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CskP41241 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CskP41241 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CskP41241 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CskP41241 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CskP41241 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CskP41241 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CskP41241 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CskP41241 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CskP41241 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms