Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LtbP41155 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LtbP41155 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtbP41155 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtbP41155 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LtbP41155 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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LtbP41155 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms