Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VhlP40338 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VhlP40338 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VhlP40338 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VhlP40338 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms