Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps26aP40336 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms