Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fen1P39749 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fen1P39749 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fen1P39749 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms