Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms