Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lig1P37913 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms