Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddit3P35639 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ddit3P35639 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms