Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grin1P35438 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grin1P35438 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms