Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd22P35329 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd22P35329 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms