Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nedd1P33215 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nedd1P33215 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms