Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pabpc1P29341 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pabpc1P29341 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms