Protein–RNA interactions for Protein: P29121

Pcsk4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk4P29121 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk4P29121 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk4P29121 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk4P29121 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk4P29121 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk4P29121 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk4P29121 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pcsk4P29121 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pcsk4P29121 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms