Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PrkcdP28867 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcdP28867 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms