Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Aco1P28271 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Aco1P28271 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Aco1P28271 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms