Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psmb9P28076 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms