Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpl3P27659 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpl3P27659 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl3P27659 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms