Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
U2af2P26369 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
U2af2P26369 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms