Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctnna1P26231 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms