Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UbtfP25976 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UbtfP25976 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms