Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk11bP24788 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk11bP24788 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms