Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm44862-201ENSMUST00000207981 1055 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hoxd11P23813 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AV039307-201ENSMUST00000124795 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Scgb2b26-201ENSMUST00000085623 579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd11P23813 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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