Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxd12P23812 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms