Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZfaP23607 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms