Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PrkchP23298 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrkchP23298 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms