Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PparaP23204 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PparaP23204 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PparaP23204 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PparaP23204 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PparaP23204 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms