Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bmp4P21275 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bmp4P21275 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms