Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PrkcaP20444 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms