Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a1P19437 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms