Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NelfeP19426 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NelfeP19426 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms