Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RargP18911 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RargP18911 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RargP18911 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RargP18911 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms