Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps6ka1P18653 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms