Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtpraP18052 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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