Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pou4f1P17208 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pou4f1P17208 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms