Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfb3P17125 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb3P17125 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms