Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sptan1P16546 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sptan1P16546 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms