Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irf1P15314 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Irf1P15314 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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