Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vpreb1P13372 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms