Protein–RNA interactions for Protein: P12979

Myog, Myogenin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyogP12979 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyogP12979 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyogP12979 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyogP12979 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyogP12979 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyogP12979 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MyogP12979 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MyogP12979 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MyogP12979 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms