Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Calb1P12658 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Calb1P12658 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Calb1P12658 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms