Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa1P11477 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms