Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatspereP0DP43 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CatspereP0DP43 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms