Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa6P09092 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxa6P09092 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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