Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefmP08553 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NefmP08553 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefmP08553 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NefmP08553 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefmP08553 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefmP08553 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NefmP08553 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NefmP08553 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NefmP08553 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefmP08553 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms