Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Spta1P08032 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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