Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd4P06332 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd4P06332 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd4P06332 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms