Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P06323 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P06323 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
P06323 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P06323 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P06323 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P06323 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P06323 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms