Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JunP05627 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JunP05627 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JunP05627 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
JunP05627 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms