Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Eb1P04230 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms