Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04213 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04213 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04213 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P04213 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P04213 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04213 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04213 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04213 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms